Pyfastra. الترتيب والملخص
- رخصة:
- MIT/X Consortium Lic...
- موقع ويب الناشر:
- http://code.google.com/u/bpederse/
Pyfastra. العلامات
Pyfastra. وصف
الوصول إلى فايتثونيك لملفات تسلسل FISA Pyfastra هي مكتبة توفر الوصول إلى FASTA Sequalce Files.usage: .. Sourcecode :: Python >>> من Pyfastra Import Fasta >>> F = FASTA ("الاختبارات / البيانات / three_chrs.fasta ') >>> (F.KEYS ()) >>> f fastagz (الاختبارات / البيانات / three_chrs.fasta.gz '، 0..80) >>> f ' actgactgac ' # يخزن الفهرس بداية وإيقاف كل رأس من ملف تي fasta >>> f.index {chr3 ': (160، 3760)،' chr2 ': (80، 160)،' chr1 ': (0، 80 . >>> ({'{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{{chr1' ' من Feata والفهرس. >>> استيراد نظام التشغيل >>> مرتبة (Os.ListDir ("الاختبارات / البيانات /")) التنظيف (على الرغم من الاستخدام الحقيقي، ستبقى هذه لصول أسرع) >>> os.unlink ('الاختبارات / البيانات / three_chrs.gdx') >>> OS.UNLINK ("الاختبارات / البيانات / three_chrs.fasta.gz") متطلبات: بيثون ما الجديد في هذا الإصدار: لا تعيد تسطح الملف في كل مرة! اسمح للمسافات قبل وبعد الرأس في FASTA Orginal.
Pyfastra. برامج ذات صلة