Bio :: Tree :: Bio :: Tree :: EABLASTORY هي وحدة بيرل لبناء شجرة باستخدام الأساليب المستندة إلى المسافة.
التحميل الان

Bio :: Tree :: الترتيب والملخص

Bio :: Tree :: العلامات

الوحدة النمطية بيرل شجرة بناء شجرة بناء مسافة شجرة

Bio :: Tree :: وصف

Bio :: Tree :: EABLASTORY هي وحدة بيرل لبناء شجرة باستخدام الأساليب المستحقة عن بعد. Bio :: Tree :: EANHFACTORY هي وحدة بيرل لإنشاء شجرة باستخدام الأسلوب المستندة إلى المسافة .Synopsis استخدام Bio :: Tree :: استخدام Bio :: Alignio؛ استخدام Bio :: محاذاة :: Dnastatistics؛ بلدي $ dfactory = bio :: tree ::::::::::: لي إحصائيات $ = BIO :: محاذاة :: Dnastatistics-> جديد ()؛ بلدي alnin alnin = bio :: Alignio-> جديد (-Format => 'clustalw'، -file => 'file.aln')؛ بلدي $ aln = $ alnin-> next_aln؛ # من مصفوفة بالطبع يمكن أن تأتي من مكان مختلف # مثل phylip إذا كنت تفضل، Bio: Matrix :: IO يجب أن تكون قادرة على تحليل العديد من الأشياء بلدي $ jcmatrix = stats $ stats-> المسافة (-align => $ aln، - - الطريقة => 'jukes-cantor')؛ بلدي شجرة $ = $ dfactory-> make_tree ($ jcmatrix)؛ هذا مصنع يقوم ببناء شجرة plogenetic بناء على مسافات التسلسل الزوجية لمجموعة من التسلسلات. يتم تنفيذ UPGMA حاليا (Sokal و Michener 1958) و NJ (Saitou و Nei 1987). متطلبات: perl.

Bio :: Tree :: برامج ذات صلة