Bio :: Tree :: متوافق Bio :: Tree :: متوافق هو وحدة بيرل لاختبار توافق الأشجار البلاستيكية مع تصوير الأصغر.
التحميل الان

Bio :: Tree :: متوافق الترتيب والملخص

Bio :: Tree :: متوافق العلامات

phylogenetic. الأشجار البلاستيجية الأشجار تآسي المتداخلة اختبار التوافق

Bio :: Tree :: متوافق وصف

Bio :: Tree :: متوافق هو وحدة بيرل لاختبار توافق الأشجار البلاستيكية مع تصوير الأصوات المتداخلة. Bio :: Tree :: متوافق هو وحدة بيرل لاختبار توافق الأشجار الفلسفية مع Taxa.Synopsis استخدم Bio :: Tree :: متوافق؛ استخدام Bio :: Treio؛ بلدي الإدخال $ = جديد Bio :: Treio ("تنسيق" => 'Newick'، '-file' => 'Input.tre')؛ بلدي $ t1 = input-> next_tree؛ بلدي T2 $ = $ input-> next_tree؛ بلدي ($ incompat، ilabels $ ilabels، iNodes $) = $ t1-> is_compatible ($ t2)؛ إذا ($ incompat) {my cluster1 = {$ t1-> cluster_representation}؛ بلدي cluster2 = {$ t2-> cluster_representation}؛ طباعة "treesn غير متوافق"؛ إذا (Scalar (@ @ $ Ilabels)) {foreach My Label $ (@ $ ilabels) {my $ node1 = $ t1-> find_node (-id => تسمية $)؛ بلدي node2 $ = $ t2-> find_node (-id => $ label)؛ My @ C1 = فرز @ {$ cluster1 {$ node1}}؛ My @ C2 = فرز @ {$ cluster2 {$ node2}}؛ طباعة "تسمية الملصقات $"؛ طباعة "الكتلة"؛ الخريطة {print ""، $ _} @ C1؛ طباعة "الكتلة"؛ الخريطة {print ""، $ _} @ C2؛ طباعة "ن"؛ }}} إذا (Scalar (@ Inodes $)) {أثناء (@ INODES $) {My Node1 $ = Shift @ $ Inodes؛ بلدي $ node2 = shift @ $ inodes؛ My @ C1 = فرز @ {$ cluster1 {$ node1}}؛ My @ C2 = فرز @ {$ cluster2 {$ node2}}؛ طباعة "الكتلة"؛ الخريطة {print ""، $ _} @ C1؛ طباعة "مجموعة تتقاطع بشكل صحيح"؛ الخريطة {print ""، $ _} @ C2؛ طباعة "ن"؛ }}} آخر {print "triesn متوافق"؛ } Bio :: Tree :: متوافق هو أداة بيرل لاختبار توافق الأشجار الفلسفية مع تصنيع الأصوات المتداخلة تمثل كائنات Bio :: Tree. يعتمد على توصيف مؤخرا للتوافق الأجداد للأشجار شبه المسمى من حيث تمثيلات المجموعة الخاصة بهم. تعد الشجرة شبه المصنفة شجرة رجالية مع بعض العقد الداخلية لها المسمى، ويمكن أن تمثل شجرة تصنيف وكذلك شجرة Phylogenetic مع Taxa المتداخلة، مع العقد الداخلية المسمى المقابلة لسيارات الأصناف بمستوى أعلى من التجميع أو التعشيش أكثر من ذلك من أشجار DESCENDENT.TWO شبه المسمى متوافقة إذا كانت قيودها الطوبولوجية في الملصقات المشتركة هي أن تكون كل علامة عقدة، تزامن أصغر مجموعات تحتوي عليه في كل من الأشجار، وعلاوة على ذلك، لا توجد كتلة في واحدة من الأشجار تتقاطع بشكل صحيح مجموعة من الأشجار الأخرى من الشجرة الأخرى. وحدة للجمع بين الأشجار الفلسية المتوافقة مع الأصناف المتداخلة في Supertree مشترك. متطلبات: perl.

Bio :: Tree :: متوافق برامج ذات صلة