Bio :: SEQ :: Seqwithquality Bio :: SEQ :: Seqwithucality هو عبوات كائن Bioperl بتسلسل بجودته.
التحميل الان

Bio :: SEQ :: Seqwithquality الترتيب والملخص

Bio :: SEQ :: Seqwithquality العلامات

الوحدة النمطية بيرل يعارض تسلسل bioperl. كائن بيوبرل التغليف التسلسلي

Bio :: SEQ :: Seqwithquality وصف

Bio :: SEQ :: Seqwithquality هو عبوات كائن Bioperl تسلسل بجودته. Bio :: Seq :: Seqwithquality هو تعبئة كائن BIOPerl تسلسل بجودي. استخدم Bio :: SEQ :: Primetyqual؛ # جعل من الذاكرة بلدي $ Qual = Bio :: SEQ :: SeqwithQuality-> جديد (-Qual => '' 1020304050502010 '، -seq =>' ATCGATCG '، -ID => -Cression_number => 'al000012'،)؛ # جعل من الكائنات # أولا، وجعل كائن my my seqobj = bio :: profilesq-> جديد (-Seq => 'atcgatcg'، -id => 'genefragment-12'،-coccession_umber => 'x78121'، الأبجدية => 'الحمض النووي)؛ # الآن قم بعمل كائن أوبيالي الخاص بي $ Qualobj = Bio :: SEQ :: Primaryqual-> جديد (-Qual => '1020304050502010'، -id => 'genefragment-12'، 'x78121'، -alpeT => 'الحمض النووي')؛ # الآن قم بعمل كائن Seqwithquality الخاص بي $ Swqobj = Bio :: Seq :: Seqwithquality-> جديد (-Seq => $ seqobj، -qual => $ qualobj)؛ # فعله! $ shoqobj-> ID ()؛ # معرف كائن Seqwithquality # قد لا يتطابق مع معرف تسلسل أو # الجودة (تحقق من جراب، Luke) $ swqobj-> SEQ ()؛ # تسلسل كائن Seqwithquality $ shaqobj-> Qual ()؛ # جودة كائن Seqwithquality # للحصول على أجزاء من التسلسل. طباعة "تسلسل"، $ Seqobj-> ID ()، "مع الانضمام"، $ seqobj-> الانضمام، "and desc"، $ seqobj-> desc، "n"؛ $ string2 = $ seqobj-> subseq (1،40)؛ متطلبات: perl.

Bio :: SEQ :: Seqwithquality برامج ذات صلة