Bio :: Index :: FISTA BIO :: FISTA هو واجهة بيرل للفهرسة (متعددة) ملف FASTA.
التحميل الان

Bio :: Index :: FISTA الترتيب والملخص

Bio :: Index :: FISTA العلامات

الوحدة النمطية بيرل فهرسة واجهة بيرل السيرة الذاتية fasta. فهرسة FASTA.

Bio :: Index :: FISTA وصف

Bio :: Index :: FISTA هو واجهة بيرل للفهرسة (متعددة) ملف FASTA. Bio :: Index :: FISTA هو واجهة بيرل للفهرسة (متعددة) Fasta Files.synopsis # رمز كامل لإجراء فهرس لعدة ملفات FASTA استخدم Bio :: Index :: FISTA؛ استخدام صارمة؛ بلدي $ index_file_name = التحول؛ My $ inx = bio :: الفهرس :: fasta-> جديد ('-filename' => $ index_file_name، "-WRITE_FLAG" => 1)؛ $ inx-> make_index (@ argv)؛ # طباعة عدة تسلسل موجودة في الفهرس # في FISA تنسيق استخدام Bio :: FISTA؛ استخدام صارمة؛ بلدي $ index_file_name = التحول؛ بلدي $ inx = bio :: الفهرس :: fasta-> جديد ('- اسم الملف' => $ index_file_name)؛ بلدي $ خارج = Bio :: SEQIO-> جديد ("- تنسيق" => 'fasta'، '- fh' => * stdout)؛ foreach بلدي معرف $ (argv) {My $ seq = $ inx-> الجلب (معرف $)؛ # إرجاع Bio :: كائن SEQ $ خارج-> Write_seq ($ SEQ)؛ } # أو، بدلا من ذلك هو معرف $؛ بلدي $ seq = $ inx-> get_seq_by_id (معرف $)؛ # الجدال في fetchinherits وظائف لإدارة ملفات DBM من Bio :: Abstract.pm، ويوفر FuntionAlity الأساسي لفهرسة ملفات FASTA، واسترجأ التسلسل منه. للحصول على أفضل النتائج 'استخدم Inditions'. BIODATABASES.POD ملف أو نصوص / فهرس / * الثابتة والمتنقلة وفي bptutorial.pl.note أنه افتراضيا مفتاح التسلسل سيكون أول سلسلة مستمرة بعد ">" في رأس FISTA. إذا كنت ترغب في استخدام فرعية محددة من رأس FISTA، فيجب عليك استخدام طريقة ID_PARSER (). متطلبات: perl.

Bio :: Index :: FISTA برامج ذات صلة