Bio :: DB :: Seqfeature :: Store :: BDB bio :: db :: seqfeature :: Store :: BDB يمكن جلب وتخزين الكائنات من berkeleydb.
التحميل الان

Bio :: DB :: Seqfeature :: Store :: BDB الترتيب والملخص

Bio :: DB :: Seqfeature :: Store :: BDB العلامات

قاعدة البيانات الوحدة النمطية بيرل بيرل تخزين الكائنات berkeleydb. قاعدة بيانات Berkeleydb

Bio :: DB :: Seqfeature :: Store :: BDB وصف

BIO :: DB :: Seqfeature :: Store :: BDB يمكن جلب وتخزين الأشياء من berkeleydb. Bio :: DB :: DB :: Seqfeature :: Store :: BDB يمكن أن تجلب وتخزين الكائنات من berkeleydb.bioperl عبارة عن حزمة من أدوات Perl النطاق العامة للحيوانات الجزيئية الحاسوبية. جميع الوحدات النمطية الموجودة في مساحة السيرة الذاتية / الاسم، بيرل ويعطي واجهة وظيفية للأجزاء الرئيسية للحزمة SEQ للتسلسلات (البروتين والحمض النووي). Bio :: PrimowerSeq هو تسلسل عادي (معرفات تسلسل + معرفات) Bio :: SEQ هو PrimedQue Plus لديه Bio :: Cheanhtation :: Chite and A Collection و Bio :: كائنات Seqfeaturei المرفقة. Bio :: SEQ :: Richseq هو كل ما سبق بالإضافة إلى فتحات للحصول على معلومات إضافية خاصة بملفات Genbank / Embl / Swissprot. Bio :: Seq :: Largeseq هو للتسلسلات الكبيرة للغاية بالنسبة للتركيب في الذاكرة. Seqio هو تسلسل القراءة والكتابة، وهي وحدة إنذار أمامية لنوحيات برنامج التشغيل منفصلة تدعم تنسيقات التسلسل المختلفة Seqfeature ابدأ / إيقاف / Strand التوضيحات Bio :: Seqfeature :: Generic هو Catsicall الأساسي Bio :: Seqfeature :: التشابه التسلسل التشابه F Aureure Bio :: Seqfeature :: Feedalpair ميزة تسلسل مقرنة مثل استعلام / Hit Pairs Searchio هو لقراءة وكتابة تقارير محاذاة الزوجية مثل الانفجار أو FASTA البحث حيث يتم تعريف كائنات المحاذاة Bio :: البحث: : النتيجة :: GenerIcResult هو كائن النتيجة (استعلام الانفجار هو كائن نتيجة لذلك) Bio :: البحث :: Generichit هو كائن Hit (سيكون لديك استعلام 0-> العديد من الزيارات في قاعدة بيانات) Bio: : البحث :: HSP :: GenerICHSP هو كائن زوج القطعة عالية التسجيل يحدد محاذاة (أسماء) الاستعلام والضرب. Simplealign هو محاذاة تسلسل متعددة Alignio هو القراءة والكتابة تنسيقات محاذاة تسلسل متعددة الجمعية توفر بداية البنية التحتية للتجمعات والتجميع :: محولات IO IO بالنسبة لهم DB هي مساحة الاسم لجميع كائنات استعلام قاعدة البيانات Bio :: DB :: Genbank / Genepept هي وحدتي استفسار NCBI Entrez للحصول على تسلسل Bio :: DB: SwissProt / Embl استعلام متصلات EMBL و SwissProt مختلفة للحصول على تسلسل Bio :: DB :: GFF هو Lincoln Stein بسرعة وخفيفة الوزن قاعدة بيانات الميزة والتسلسل التي هي الخلفية لنظام GBROWSE الخاص به (انظر www.gmod.org) Bio :: DB :: Flat هو تطبيق سريع لنظام فهرسة الملفات المسطحة OBDA (عبر اللغة والمنصة عبر المنصة O | B | F | F المشاريع انظر http://obda.open-bio.org). Bio :: DB :: BioFetch / DBFetch for OBDA، Web (HTTP) الوصول إلى قواعد البيانات البعيدة. Bio :: DB :: Inmemorycache / FileCache (التخزين المؤقت المحلي السريع للتسلسلات من DBS عن بعد لتسريع وصولك). Bio :: DB :: Registry واجهة إلى مواصفات OBDA لمصادر البيانات عن بعد Bio :: DB :: XEMBL SOAP الوصول إلى قواعد بيانات التسلسل Bio :: DB :: Biblio للوصول إلى قواعد البيانات الببليوغرافية عن بعد. مجموعة التعليق التوضيحي الكائنات (التعليقات، DBLinks، المراجع، وتقدم أزواج المفتاح / القيمة) التنسيق هو نظام لرسم الخرائط بين أنظمة الإحداثيات المختلفة مثل الحمض النووي للبروتين أو بين التجميعات. مؤشر FORSFLISS مفهرف محليا مع Berkeleydb أدوات تحتوي على العديد من المحللين المتنوعين ووظيفة لاحتياجات التنبؤات الحيوية المختلفة محلل التنبؤ الجيني (GENSCAN، MZEF، GRALE، GENEMARK) تأكل التوضيحي (GFF) محاكاة تقييد الانزيم القطع مع RestrictionEnzyme تعداد طاولات Codon وتسلسلات سارية (براد، IUPAC) تحليل برنامج Phylogenetic ( PAML، MOLPHY، PHILEIP) تعيين تمثيل الخريطة الوراثية والفيزيائية الرسومات تقدم تسلسل مع ميزاتها أو نتيجة تحليل التسلسل. هيكل تحليل وتمثل هيكلة البروتين e البيانات Treio Treio مخصص لتنسيقات شجرة القراءة والكتابة Tree هي مساحة الاسم لجميع كائنات الأشجار المرتبطة بها Bio :: Tree: Tree هي كائن الشجرة الأساسية Bio :: Tree :: Node هي العقد التي تشكل Tree Bio :: Treets :: الإحصائيات هي لغسل الحوسبة إحصائيات لشجرة Bio :: Treefunctionsi هي حيث يتم تنفيذ وظائف شجرة محددة (مثل is_monophyletic و LCA) Bio :: Biblio هي حيث البيانات الببليوغرافية وكائنات الوصول إلى قاعدة البيانات يتم الاحتفاظ به تمثيل الاختلاف تسلسلات مع الطفرات والاختلافات المطبقة حتى يمكن للمرء أن يقارن ويمثل إصدارات من النوع البري والطفل من سلسلة من التسلسل. الجذر، الكائنات الأساسية للغات الحيوية من BioperlRequirs: متطلبات بيرل: perl.

Bio :: DB :: Seqfeature :: Store :: BDB برامج ذات صلة