Bio :: DB :: GFF :: ميزة
التحميل الان

Bio :: DB :: GFF :: ميزة الترتيب والملخص

Bio :: DB :: GFF :: ميزة العلامات

الوحدة النمطية بيرل مكتبة بيرل بيرل وحدة الجزء النسبي

Bio :: DB :: GFF :: ميزة وصف

Bio :: DB :: GFF :: ميزة هي شريحة نسبية تم تحديدها بواسطة نوع ميزة. Bio :: DB :: GFF :: ميزة هو شريحة نسبية تم تحديدها بواسطة نوع ميزة .bio:b::db::::::DB::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::_ يرث من Bio :: DB :: GFF :: RESSIONS، وكذلك لديه كل دعم المعالجة النسبية لهذه الفئة وأجدادها. كما يرث من bio :: seqfeaturei وكذلك لديه بداية مألوفة ()، توقف ()، و profyle_tag () وطرق الموقع () (تنفذ Bio :: locationi أيضا، إذا لزم الأمر) .bio :: DB :: GFF: : يضيف ميزة أساليب جديدة لاسترداد نوع التوضيح والجماعة والسمات GFF الأخرى. يتم تمثيل أنواع التوضيحية بواسطة Bio :: DB :: GFF :: TypeName كائنات، فئة بسيطة تحتوي على طريقتين تسمى الطريقة () والمصدر (). تتوافق هذه مع الطريقة ومصدر مجالات ملفات FILE.AMNOTIONATIONATIOND الغرض المزدوج المتمثل في إعطاء التوضيحية اسم قابلا للقراءة، وتوفير مجموعة فرعية ترتيب أعلى في الميزات. المجموعات التي تم إرجاعها بواسطة هذه الوحدة هي كائنات من الفئة Bio :: DB :: GFF ::BIO:BIO:BIO:BIO ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: وترثها وحدات Bioperl الأخرى.generally، لن تقوم بإنشاء أو معالجة كائنات ميزة BIO :: DB :: GFF :: ميزة الميزة مباشرة، ولكن استخدام تلك التي يتم إرجاعها بواسطة الأسلوب Bio :: DB :: GFF :: RELSEMES-> طريقة الميزات (). ملاحظة مهمة حول البداية () مقابل نهاية () إذا كانت الميزات مشتقة من القطاعات التي تستخدم العناوين النسبية (أي افتراضي)، فإن البدء () ستكون أقل من النهاية () إذا كانت الميزة موجودة في حبلا المعاكس من التسلسل المرجعي وبعد هذا يكسر امتثال Bio :: Seqi ميزات منه. سيؤدي ذلك إلى إجبار كل شيء في إحداثيات مطلقة. مثال: شريحة $ = $ DB-> الجزء ('Chromosome_i')؛ قطاع $-> مطلق (1)؛ MyFeatures = مقطع $-> الميزات ("النص")؛ متطلبات: perl.

Bio :: DB :: GFF :: ميزة برامج ذات صلة