Bio :: Alignio :: MSF

Bio :: Alignio :: MSF هو وحدة بيرل مع تيار الإخراج التسلسل / إخراج MSF.
التحميل الان

Bio :: Alignio :: MSF الترتيب والملخص

الإعلانات

  • Rating:
  • رخصة:
  • Perl Artistic License
  • السعر:
  • FREE
  • اسم الناشر:
  • Peter Schattner
  • موقع ويب الناشر:
  • http://search.cpan.org/~birney/bioperl-1.4/Bio/Tools/BPlite/HSP.pm

Bio :: Alignio :: MSF العلامات


Bio :: Alignio :: MSF وصف

Bio :: Alignio :: MSF هو وحدة بيرل مع تدفق إدخال تسلسل MSF / إخراج. Bio :: Alignio :: MSF هو وحدة بيرل مع تدفق تسلسل MSF / إخراج Stream.synopsisdo لا تستخدم هذه الوحدة مباشرة. استخدمه عبر Class Bio :: Alignio Class.This يمكن أن يحول هذا الكائنات الحيوية :: كائنات Aligni من وإلى قواعد بيانات الملفات المسطحة من أطباء بلا حدود. بقية تفاصيل الوثائق كل أساليب الكائنات. عادة ما تكون الأساليب الداخلية سبق عادة مع _Next_alntitle: next_alnusage: $ aln = $ stream-> next_aln () وظيفة: إرجاع المحاذاة التالية في الدفق. يحاول قراءة * All * MSF يقوم بقراءة جميع الأحرف غير المستقيمة في منطقة المحاذاة. بالنسبة إلى MSFS مع فجوات غريبة (على سبيل المثال ~~~) تعيينها باستخدام $ All-> Map_Chars ('~'، ') إرجاع: L Objectargs: Writew_alnusage: $ stream- > Write_aln (@ aln) وظيفة: يكتب الكائن ALN $ في الدفق بتنسيق تنسيق MSF يتم تحديد نوع المحاذاة بواسطة التسلسل الأول. Returns: 1 للنجاح و 0 ل Errorargs: L متطلبات الكائنات: perl.


Bio :: Alignio :: MSF برامج ذات صلة

معلومات عنا