Bio :: حكيم :: المقارنة Bio :: Sage :: وحدة المقارنة تقارن البيانات من التحليل التسلسلي لمكتبات التعبير الجيني (SAGE).
التحميل الان

Bio :: حكيم :: المقارنة الترتيب والملخص

Bio :: حكيم :: المقارنة العلامات

الوحدة النمطية بيرل تحليل الجينات تحليل حكيم جين حكيم

Bio :: حكيم :: المقارنة وصف

Bio :: Sage :: وحدة المقارنة تقارن البيانات من التحليل التسلسلي لمكتبات التعبير الجيني (SAGE). Bio :: Sage :: وحدة المقارنة تقارن البيانات من التحليل التسلسلي للتعبير الجيني (SAGE) المكتبات .Synopsis استخدم Bio :: Sage :: مقارنة؛ Sage $ = Bio :: Sage :: المقارنة -> جديد ()؛ توفر هذه الوحدة العديد من الأدوات لمقارنة البيانات الناتجة عن التحليل التسلسلي لمكتبات التعبير الجيني (حكيم) .backpresserial تحليل التعبير الجيني (حكيم) هو تقنية جزيئية لتوليد لقطة عالمية شبه عالمية من نسخة سكان الخلية. لفترة وجيزة، تستخرج التقنية تسلسلات قصيرة في مواقع محددة من مرنا المنشأ. ثم يتم إقران هذه التسلسلات القصيرة لتشكيل ditags. تم تسليم دائرة الأبقار لتشكيل تسلسل طويل ثم استنساخ. يتم بعد ذلك تسلسل الحمض النووي المستنسخ. ثم يتم استخدام تقنيات المعلوماتية الحيوية لتحديد تسلسل العلامات القصيرة الأصلية، واستخلاص بروجها مرنا. يمكن ملاحظة عدد المرات التي لوحظ وجود علامة معينة لترميم كمية نصية معينة. وصفت التقنية الأصلية من قبل Velculescu et al. (1995) واستخدمت علامة تسلسل ~ 14BP. تم تقديم البروتوكول المعدل من قبل SAHA et al. (2002) أنتجت Tags ~ 21BP.Purposethis تسهيل مقارنة مكتبات حكيم. على وجه التحديد: 1. حسابات لتحديد الأهمية الإحصائية للاختلافات التعبير. 2. قم بتحويل مكتبات العلامات الطويلة بشكل حيوي إلى نوع أقصر للمقارنة (على سبيل المثال مقارنة لونوح Longsage مقابل مكتبة Sage منتظمة). بغيض منتظم Sage (علامة 14mer) و Longsage (علامة 21mer) هي مدعومة من هذه الوحدة. الأهمية المثالية في المكتبة يتم احتساب المقارنات باستخدام الطريقة التي وصفها Audic و Claverie (1997). تم إنشاء رمز من خلال قم بتنفيذ المصدر الأصلي للمؤلفين "Requirements".

Bio :: حكيم :: المقارنة برامج ذات صلة