Bio :: تقييد :: إنزيم Bio :: تقييد :: إنزيم هو تقييد واحد indonuclease (يقطع الحمض النووي في مواقع محددة).
التحميل الان

Bio :: تقييد :: إنزيم الترتيب والملخص

Bio :: تقييد :: إنزيم العلامات

الوحدة النمطية بيرل السيرة الذاتية انزيم التقييد تقييد indonuclease. تقييد

Bio :: تقييد :: إنزيم وصف

Bio :: Readriction :: Enzyme هو تقييد واحد Endonuclease (تخفيض الحمض النووي في مواقع محددة). Bio :: Readriction :: Enzyme هو تقييد واحد Endonuclease (تخفيض الحمض النووي في مواقع محددة) .Synopsis # إعداد إنزيم تقييد واحد. يحتوي هذا على الكثير من # معلومات حول الإنزيم التي يتم تحليلها بشكل عام من ملف Rebase ويمكن بعد ذلك قراءة مرة أخرى استخدام Bio :: تقييد :: إنزيم؛ # حدد إنزيما جديدا مع تسلسل قطع بلدي $ RE = قيود جديدة :: Enzyme: Enzyme (-enzyme => 'Ecori'، -Seq => 'G ^ Aattc')؛ # بمجرد تحديد التسلسل حفنة من الأشياء محسوبة # بالنسبة لك: #### مبدأ # العثور على حيث تخفض الانزيم بعد ... بلدي $ CA = $ RE-> خفض؛ # ... وأين تخفيضات على عكس حبلا بلدي $ oca = $ RE-> complementary_cut؛ # الحصول على سلسلة تسلسل قطع الظهر. # لاحظ أن الموقع سيعود التسلسل مع Caret My $ with_caret = $ RE-> الموقع؛ # Returns 'g ^ aattc'؛ # لكنه أيضا كائن Bio :: ProfySq .... My $ بدون recaret = $ RE-> SEQ؛ # إرجاع "gaattc"؛ # ... وهكذا يفعل سلسلة $ بدون _caret = سلسلة $ # Returns 'gaattc'؛ # ما هو التكميل العكسي للموقع قطع بلدي RC = $ RE-> RevCom؛ # إرجاع "gaattc"؛ # الآن طول الاعتراف. هناك نوعان: # التعرف على الطول () هو طول التسلسل # القاطع () تقدير تردد قطع بلدي recog_length $ = $ RE-> التعرف_ # إرجاع 6 # إرجاع أيضا 6 في هذه الحالة ولكن سيعود # 4 ل GANNTC و 5 ل Rhatcy (BSTX2i)! $ recog_length = $ RE-> القاطع؛ # هو التسلسل palindrome - نفس الأمام والخلف بلدي $ pal = $ re-> palindromic؛ # هذا هو المنطقي # هو أكثر صرخة التسلسل (أي لا يتجاوز overhang - التخفيضات إلى الأمام والعكسية هي نفسها) طباعة "بلونتين" إذا كانت $ RE-> overhang eq 'blund'؛ # overhang يمكن أن يكون لها ثلاثة قيم: "5" "،" 3 "،" حادة "، واتجاه رقم الحكم # مهم جدا إذا كنت تستخدم klenow! بلدي $ أوه = $ re-> overhang؛ # ما هو التسلسل المتراكب بلدي $ ohseq = $ RE-> overhang_seq؛ # سوف تعود "Aatt"؛ # هو تسلسل غامض - هل يحتوي على قواعد غير GATC؟ بلدي AMBIG = $ RE-> is_bigiguous؛ # هذه هي طباعة منطقية "الأشياء حول الإنزيمينس بعد: $ can"، "قطع تكميلية: $ ocansite: NT $ with_caret orn"، "t $ witkaretn"؛ طباعة "عكس التسلسل: طول $ Rcnrecockion الطول: $ recog_livendnn"، "هل هو palindromic؟ $ paln"؛ طباعة "Overhang هو $ أوه مع التسلسل $ ohseqn"، "وهل هو غامض؟ $ ambignn"؛ ### أشياء يمكنك ضبطها، والحصول عليها من ملف Rebase Rebase # احصل على أو تعيين Isoschizomers (الإنزيمات التي تتعرف على نفس الموقع) $ RE-> Isoschizomers ('Pvuii'، 'Smai')؛ # ليس صحيحا حقا :) طباعة "isoschizomers"، انضم ""، $ re-> isoschizomers، "n"؛ # احصل على أو ضبط مواقع الميثيل $ RE-> Methylation_sites (2)؛ # ليس صحيحا حقا :) طباعة "ميثيل في"، انضم "، مفاتيح {$ re-> methylation_sites}،" n "؛ # اجعل أو تعيين ميكروم المصدر $ RE-> الميكروب ('E. كولي')؛ طباعة "جاءت من"، RE-> Microbe، "N"؛ # احصل على أو تعيين الشخص الذي عزل IT RE-> المصدر ("ROB")؛ # ليس صحيحا حقا :) طباعة $ RE-> المصدر، "أرسلها إلى USN"؛ # احصل على أو تعيين ما إذا كانت متاحة تجاريا والشركة # أنه يمكن شراؤها عند إعادة البائعين $ (NEB ')؛ # طباعتي المفضلة "هل هو متاح تجاريا:"؛ طباعة $ RE-> البائعين؟ "نعم / لا"؛ طباعة "ويمكن الحصول عليها من"، الانضمام ""، $ RE-> البائعين، "N"؛ # احصل على أو تعيين مرجع لهذا المرجع $ ("Edwards et al. J. الجراثيم")؛ طباعة "لم يتم نشره في"، RE-> مرجع "،" N "؛ # الحصول على أو تعيين اسم الإنزيم $ RE-> الاسم ('bamhi')؛ طباعة "اسم Ecori ليس حقا"، $ RE-> اسم "N"؛ تحدد هذه الوحدة تقييدا واحدا indonuclease. يمكنك استخدامه لجعل إنزيمات تقييد مخصصة، ويتم استخدامه بواسطة Bio :: تقييد :: IO لتحديد الإنزيمات في مجموعة Rebase New England Biolabs Rebase.use Bio :: تقييد :: تحليل لمعرفة أي إنزيمات متوفرة وأين قطعوا التسلسل الخاص بك. متطلبات: perl.

Bio :: تقييد :: إنزيم برامج ذات صلة