Bio :: الأدوات :: GucessSeqFormat وحدة نمطية لتحديد تنسيق تسلسل محتويات الملف أو السلسلة أو من خلال filehandle
التحميل الان

Bio :: الأدوات :: GucessSeqFormat الترتيب والملخص

Bio :: الأدوات :: GucessSeqFormat العلامات

الوحدة النمطية بيرل بيرل صيغة تسلسل تنسيق التسلسل سلسلة filehandle

Bio :: الأدوات :: GucessSeqFormat وصف

وحدة نمطية لتحديد تنسيق تسلسل محتويات الملف أو سلسلة أو من خلال filehandle Bio :: Tools :: GressSeqFormat هو وحدة بيرل لتحديد تنسيق تسلسل محتويات ملف أو سلسلة أو من خلال ملف filehandle.synopsis لتخمين تنسيق ملف مسطح، مع إعطاء اسم ملف: My $ simecher = Bio :: أدوات :: GuessSeqFormat-> جديد (-file => $ اسم الملف)؛ بلدي شكل $ = خصم $ -> تخمين؛ # لتخمين التنسيق من ملف filehandle مفتوح بالفعل: بلدي خصم $ sime = bio :: الأدوات :: gressseqformat-> جديد (-fh => $ filehandle)؛ بلدي شكل $ = خصم $ -> تخمين؛ # إذا كان Filehandle هو قابل للبحث عن (Stdin ليس)، فسيتم ذلك # عاد إلى موضعه الأصلي. # لتخمين تنسيق واحد أو عدة أسطر من النص (مع # Newlines غير المدمجة): بلدي $ تخميس = bio :: الأدوات :: gressseqformat-> جديد (-Text => $ linesoftext)؛ بلدي شكل $ = خصم $ -> تخمين؛ . $ تخييس-> الملف (اسم الملف $)؛ خصم -> FH ($ filehandle)؛ خصم -> النص (Linesoftext)؛ # لتخمين في واحد الذهاب، معطى على سبيل المثال اسم الملف: بلدي تنسيق $ = Bio :: Tools :: MissSeqFormat-> جديد (-file => $ اسم الملف) -> تخمين؛ Bio :: الأدوات :: TransSeqFormat يحاول تخمين التنسيق ("السويسري"، "PIR"، "FASTA" وما إلى ذلك) من التسلسل أو MSA في ملف، في مجموعة فرعية، أو من خلال Filehandle. طريقة تخمين (). سيقوم كائن SICESSEQFormat بفحص البيانات، سطر حسب الخط، حتى ذلك يجد خطا يمكن تعيين تنسيق واحد فقط. إذا لم يكن هناك تخمين قاطع، فسيتم إرجاع برنامج الأمم المتحدة للرقم. إذا كانت الأدوات الحيوية :: كائن SICMSEQFormat يتم إعطاء ملف filehandle الذي يمكن البحث فيه، فسيتم استعادته إلى موقعه الأصلي عند العودة من طريقة تخمين (). متطلبات: perl.

Bio :: الأدوات :: GucessSeqFormat برامج ذات صلة