Bio :: أدوات :: Run :: PIPEAPPLIation :: توافق في الآراء Bio :: أدوات :: Run :: PISEAPPLIation :: إجماع هو وحدة بيرل.
التحميل الان

Bio :: أدوات :: Run :: PIPEAPPLIation :: توافق في الآراء الترتيب والملخص

Bio :: أدوات :: Run :: PIPEAPPLIation :: توافق في الآراء العلامات

الوحدة النمطية بيرل غير إجمالي الحمض النووي غير الموحد تسلسل البروتين الحمض النووي

Bio :: أدوات :: Run :: PIPEAPPLIation :: توافق في الآراء وصف

Bio :: أدوات :: Run :: PISEAPPLIation :: إجماع هو وحدة بيرل. Bio :: Tools :: Run :: PISEAPPLIation :: توافق في الآراء هو نموذج Perl.Bioperl فئة من أجل: تحديد توافق في الآراء من أنماط الإجماع في الحمض النووي والبروتين غير إجمالي (Hertz، Stormo) المراجع: G.Z. هيرتز و g.d. Stormo. تحديد أنماط توافق في الآراء في تسلسل الحمض النووي والبروتين غير إجمالي: أساس إحصائي انحراف كبير لمعاقبة الفجوات. في: وقائع المؤتمر الدولي الثالث حول المعلوماتية الحيوية وبحوث الجينوم (H.A. Lim، و C.R. كانتور، المحررين). عالم النشر العالمي المحدودة سنغافورة، 1995. الصفحات 201-216. المعلمات: (انظر أيضا: http://bioweb.pasteur.fr/seqanal/interfaces/consensus.html للقيم المتاحة): إجماع (استثناء) برنامج لتشغيل التسلسل (التسلسل التسلسل) الملفات (-F) الأنابيب: عرض SEQSFILE ( عدد صحيح) عرض النمط (الإجماع فقط) (-l) out (strings) expressus_matrix (encl) تكمل تسلسل الحمض النووي (-c) ASCII_ALPHABET (Insile) معلومات الحروف الأبجدية والتطبيع (إن لم يكن الحمض النووي) (-a ) مسبقا (التبديل) استخدم الاحتمالات السابقة للرسائل لتجاوز الترددات المرصودة (-d) الحمض النووي (التبديل) الأبجدية (مفتاح) معلومات التطبيع وبروتين الحمض النووي (مفتاح التبديل) الأبجدية والتعبير المعلومات عن قائمة انتظار البروتين (عدد صحيح) الحد الأقصى لعدد المصفوفات للحفظ بين دورات البرنامج - أي: عدد قائمة الانتظار (-ساعة) القياسية (تعويم) من الانحرافات المعيارية لخفض محتوى المعلومات في كل موقف قبل تحديد قمم المعلومات (إلزامي ل WCONSENSUS) ذرية (EXC) حفظ أعلى مصفوفات ذرية (-pr1) لي تقريبا (التبديل) البذور مع التسلسل الأول والمضي قدما خطيا من خلال القائمة (-l) max_cycle_nb (عدد صحيح) الحد الأقصى لتكرار دورة بناء المصفوفة (-n أو -N) max_cycle (isc) عدد الكلمات لكل مصفوفة لكل تسلسل المساهمة (-n أو -N) المسافة (عدد صحيح) الحد الأدنى للمسافة بين نقاط البداية للكلمات داخل نفس نمط المصفوفة (-2) إنهاء البرنامج (عدد صحيح) إنهاء البرنامج هذا العدد من الدورات بعد تحديد المحاذاة الحالية الأكثر أهمية (- T) Terminal_GAP (إكسم) برخص الثغرات المحطة الطرفية (-pg) (WCONSENSUS فقط) عدد المصفوفات (عدد صحيح) (عدد صحيح) لطباعة (عدد صحيح) من المصفوفات (عدد صحيح) لمتطلبات الطباعة (-pf) perl.

Bio :: أدوات :: Run :: PIPEAPPLIation :: توافق في الآراء برامج ذات صلة