Bio :: أدوات :: Run :: Analysis

BIO :: أدوات :: تحليل: هي وحدة نمطية تمثل أي أداة تحليل (عن بعد أو محلي).
التحميل الان

Bio :: أدوات :: Run :: Analysis الترتيب والملخص

الإعلانات

  • Rating:
  • رخصة:
  • Perl Artistic License
  • السعر:
  • FREE
  • اسم الناشر:
  • Martin Senger
  • موقع ويب الناشر:
  • http://search.cpan.org/~birney/bioperl-run-1.4/Bio/Tools/Run/Analysis.pm

Bio :: أدوات :: Run :: Analysis العلامات


Bio :: أدوات :: Run :: Analysis وصف

السيرة الذاتية :: أدوات :: :: تشغيل تحليل بيرل هو وحدة تمثل أي أداة تحليل (البعيد أو المحلي). السيرة الذاتية :: أدوات :: :: تشغيل تحليل بيرل هو وحدة تمثل أي (البعيد أو المحلي) تحليل tool.SYNOPSIS تحليل # تشغيل 'seqret "استخدام الموقع الافتراضي والأسلوب الافتراضي # وصول (الذي يعني استخدام خدمة ويب في بنك الإمارات الدولي ) استخدام بيو :: أدوات :: :: تشغيل تحليل. طباعة جديدة بيو :: أدوات :: :: تشغيل تحليل (-اسم => 'تحرير :: seqret') -> wait_for ({sequence_direct_data => 'tatatacgtatacga، osformat =>' EMBL '}) -> نتيجة (' outseq ')؛ # تشغيل مهمة أطول دون انتظار لاستخدامه الانتهاء بيو :: أدوات :: :: تشغيل تحليل. بلدي $ = وظيفة جديدة بيو :: أدوات :: :: تشغيل تحليل (-اسم => 'تحرير :: seqret') -> تشغيل ({sequence_direct_data => 'tatatacgtatacga، osformat =>' EMBL '})؛ # ... وبعد فترة من الوقت تعزيز العمل $> نتيجة ( 'outseq')؛ # الحصول على جميع النتائج في نفس الاحتجاج (كما هو # التجزئة المرجعية مع أسماء نتيجة كمفاتيح) - ترك الوحدة التي تقرر # النتائج (الصور في هذه الأمثلة) الثنائية وحفظ تلك # في ملف (أو الملفات). كما أنه يظهر كيف أن أقول أن وحدة # يجب قراءة إدخال البيانات من ملف استخدام المحلي الأول بيو :: أدوات :: :: تشغيل تحليل. نتائجي $ = جديدة بيو :: أدوات :: :: تشغيل تحليل (-اسم => 'alignment_multiple :: prettyplot') -> wait_for ({msf_direct_data => '@ / الوطن / testdata / my.seq'}) -> النتائج ('؟')؛ استخدم البيانات :: Dumper؛ طباعة قلابة (نتائج البحث $)؛ # الحصول على أسماء وأنواع جميع المدخلات والنتائج، # الحصول قصيرة ومفصلة (في XML) وصف الخدمة استخدام بيو :: أدوات :: :: تشغيل تحليل. خدمة $ بلدي = جديدة بيو :: أدوات :: :: تشغيل تحليل (-اسم => 'تحرير :: seqret')؛ بلدي $ hash1 = $ المصرية-> input_spec. بلدي $ hash2 = $ المصرية-> result_spec. بلدي $ hash3 = $ المصرية-> analysis_spec. بلدي $ أكس = $ المصرية-> وصف. # تحصل الحالي استخدام حالة مهمة بيو :: أدوات :: :: تشغيل تحليل. طباعة جديدة بيو :: أدوات :: :: تشغيل تحليل (-اسم => 'تحرير :: seqret') -> تشغيل ({# ... إدخال البيانات ...}) -> حالة. # تشغيل مهمة وطباعة ID وظيفتها، والحفاظ على وظيفة استخدام دمرت الامم المتحدة بيو :: أدوات :: :: تشغيل تحليل. بلدي $ = وظيفة جديدة بيو :: أدوات :: :: تشغيل تحليل (-اسم => 'تحرير :: seqret، -destroy_on_exit => 0) -> تشغيل ({sequence_direct_data =>' @ / الوطن / testdata / mzef. يليها '})؛ طباعة $ تعزيز العمل> معرف. "ن"؛ # ... فإنه يطبع (على سبيل المثال): # تحرير :: seqret / c8ef56: ef535489ac: -7ff4 # ... في وقت آخر، على كوكب آخر، يمكن القول استخدام بيو :: أدوات :: :: تشغيل تحليل. بلدي $ = وظيفة جديدة بيو :: أدوات :: :: تشغيل تحليل :: الوظيفة (-اسم => 'تحرير :: seqret، -id =>' تحرير :: seqret / c8ef56: ef535489ac: -7ff4 ')؛ بطباعة انضمام ( "ن"، $ تعزيز العمل> حالة، 'تشطيب:' $ تعزيز العمل> انتهت (1)، # (1) وسائل 'تنسيق' 'الوقت المنقضي:' $ تعزيز العمل> المنقضي $ تعزيز العمل > last_event، $ تعزيز العمل> نتيجة ( 'outseq'))؛ # ... أو قد تحقيق نفس وحدة حفظ # بيو :: أدوات :: :: تشغيل تحليل :: الوظيفة استخدام غير مرئية بيو :: أدوات :: :: تشغيل تحليل. بلدي $ = وظيفة جديدة بيو :: أدوات :: :: تشغيل تحليل (-اسم => 'تحرير :: seqret') -> create_job ( 'تحرير :: seqret / c8ef56: ef535489ac: -7ff4')؛ بطباعة انضمام ( "ن"، $ تعزيز العمل> حالة، # ...)؛ # ... وبعد ذلك يمكنك تحرير هذه الموارد المهمة $ تعزيز العمل> إزالة. # # --- راجع وصف لاستخدام مولد "applmaker.pl ': # المتطلبات: perl.


Bio :: أدوات :: Run :: Analysis برامج ذات صلة