| Bio :: أدوات :: BPLITE :: HSP Bio :: أدوات :: BPLITE :: HSP هو تقرير انفجار زوج مرتفع للغاية (HSP). |
التحميل الان |
Bio :: أدوات :: BPLITE :: HSP الترتيب والملخص
- رخصة:
- Perl Artistic License
- اسم الناشر:
- Peter Schattner
- موقع ويب الناشر:
- http://search.cpan.org/~birney/bioperl-1.4/Bio/Tools/BPlite/HSP.pm
Bio :: أدوات :: BPLITE :: HSP العلامات
Bio :: أدوات :: BPLITE :: HSP وصف
Bio :: الأدوات :: BPLITE :: HSP هو تقرير انفجار زوج مرتفع للغاية (HSP). Bio :: أدوات :: BPLITE :: HSP هو تقرير انفجار زوج مرتفع للغاية (HSP) .Synopsis استخدم Bio :: أدوات :: BPLITE؛ لي تقرير $ = جديد Bio :: أدوات :: BPLITE (-FH => * STDIN)؛ } $ hsp-> البتات؛ $ HSP-> النسبة المئوية؛ $ hsp-> p؛ $ HSP-> المباراة؛ $ hsp-> إيجابي؛ $ HSP-> طول؛ $ hsp-> queryseq؛ $ hsp-> sbjctseq؛ $ hsp-> homatherseq؛ $ hsp-> الاستعلام-> ابدأ؛ $ hsp-> الاستعلام-> نهاية؛ $ hsp-> hit-> البدء؛ $ hsp-> hit-> نهاية؛ $ hsp-> hit-> seq_id؛ $ hsp-> hit-> التداخل ($ exon)؛ }} # الخط التالي يأخذك إلى التقرير التالي في الدفق / الملف # سيعود 0 إذا كان هذا التقرير فارغا، # ولكن هذا صحيح لتقرير انفجار فارغ. # إرجاع -1 ل eof. أخيرا إذا تقرير $ -> _ parseheader == -1؛ إعادة redo} يعالج هذا الكائن بيانات زوج التسجيل العالية لتقرير انفجار. هذه هي المكان الذي يتم فيه تخزين هوية النسبة المئوية والاستعلام وضغط طول التسلسل، قيمة P، إلخ، حيث توجد معظم المعلومات اللازمة عند بناء المنطق حول تحليل تقرير الانفجار. متطلبات: perl.
Bio :: أدوات :: BPLITE :: HSP برامج ذات صلة