BIOPY-ISATAB. python parser isatab
التحميل الان

BIOPY-ISATAB. الترتيب والملخص

BIOPY-ISATAB. العلامات

مكتبة بيثون بيثون محلل

BIOPY-ISATAB. وصف

Biopy-Isatab عبارة عن محلل ثعبان لاستخراج المعلومات من البيانات الوصفية المنسقة ISA-Tab. الاستخدام هو: من BCBio استيراد ISATAB REC = ISATAB.PLESSE (ISATAB_METADATA_DIRECTORY) يطابق السجل الذي تم إرجاعه التحقيق العام / الدراسة / دراسة ISATAB. يحتوي كائن ISATABRecord المستوى الأعلى على معلومات حول التحقيق، إلى جانب معلومات الدراسة ككائنات ISATABSTUDUDRECORD. يحتوي كل سجل على معلومات الفحص في ISATABASSAYrecord الكائنات الفرعية. يتم وصف الإخراج بمزيد من التفاصيل في وحدة المحلل المحلل: https: //github.com/isa-tools/biopy-isatab/briob/master/bcbio/pcbio/pacbiab/parser.pyand يحتوي دليل الاختبار على مثال لاستخراج الاستخدام والاستخراج: https: //github.com/isa-tools/biopy-isatab/briob/master/test/test_isatab.pyyou يمكن أيضا عرض بنية كائن عن طريق طباعة ذلك: >> > طباعة ISATAB_REC * ASATAB سجل البيانات الوصفية: {} الدراسات: * دراسة البيانات الوصفية: {"وصف الدراسة": 'C2C12 Mouse خلايا العضلات الهيكل العظمي'، "معرف الدراسة": "SB-S-1"، "تاريخ تقديم الدراسة": 2010-10-04 '} العقد: * عقدة C2C12 Sample3 Sample3 Sample3 Name Name Metadata: {' اسم العينة ': ، "الكائنات الحية": } الصفحة الرئيسية للمنتج

BIOPY-ISATAB. برامج ذات صلة