نيبيو يتكون مشروع NEOBIO من خوارزميات المعلوماتية الحيوية في جافا.
التحميل الان

نيبيو الترتيب والملخص

نيبيو العلامات

الخوارزميات مادة الاحياء خوارزميات علم الأحياء خوارزميات المحاذاة البرمجة الديناميكية نيبيو

نيبيو وصف

يتكون مشروع NEOBIO من خوارزميات المعلوماتية الحيوية في Java. يتكون مشروع NEOBIO من خوارزميات معلوماتية دولية في Java.What الخوارزميات؟ يتكون الإصدار الحالي بشكل أساسي من خوارزميات محاذاة التسلسل (الزوجية) مثل طرق البرمجة الديناميكية الكلاسيكية للتأكيد و Wunsch (المحاذاة العالمية) و Smith و Waterman (المحاذاة المحلية). أي شيء آخر؟ نعم، يتوفر أيضا نهج أكثر كفاءة، بسبب Crochemore و Landau و ZiV-Ukelson. يستخدم ضغط lempel-ziv لتسريع حساب مصفوفة البرمجة الديناميكية. كما أنه يعتمد على خوارزمية Smawk، بسبب Aggarwal et al.، الذي يحسب كل العمود Maxima من مصفوفة راتمة تماما في الوقت الخطي. وجميع خوارزميات محاذاة التسلسل تدعم مخططات تسجيل بسيطة وكذلك مصفوفات الاستبدال مثل القياسية مصفوفات Blosum و PAM. ولكن حتى الآن يدعمون وظائف جزاء الفجوة الثابتة فقط. قد تحتوي الإصدارات المستقبلية على خوارزميات ذات صلة مثل محاذاة التسلسل المتعددة، والتنبؤ ببنية قواعد البيانات وبنية البروتين. واو ... أخيرا وليس آخرا، كما يوفر Neobio أدوات قائمة على خطي واجهة المستخدم الرسومية وبسيطة لتشغيل خوارزميات محاذاة التسلسل على تسلسل الحمض النووي والبروتين وبعد

نيبيو برامج ذات صلة