 | مخطط RFLP. |
| التحميل الان | |
مخطط RFLP. الترتيب والملخص
الإعلانات
مخطط RFLP. العلامات
مخطط RFLP. وصف
RFLP Planner هو أداة تساعد على تخطيط تجربة RFLP. RFLP Planner هي أداة تساعد على تخطيط تجربة RFLP: إنها تجد إنزيمات تقييد تقصي مجموعة من تسلسل الحمض النووي المتماثل بطرق مختلفة ويقوم بمحاكاة الصورة الناتجة عن الهلام الناتج. يساعدك البرنامج في العثور على إنزيمات التقييد الحيوية التي تميز السكان. من خلال محاكاة الكهربائي، من السهل اختيار أنزيمات التقييد التي تظهر أفضل تعدد الأشكال على الجل. وهي الكلمة الرئيسية المهمة هي التنوع البيولوجي. إن بعض الملامح الرئيسية ل "مخطط RFLP": محاكاة Gelimages (PNG): كل تسلسل صورة واحدة وبعد كل صورة مع علامة الوزن الجزيئي. كل تقييد إنزيم فتحة واحدة. يتم إجراء تقييم مع قاعدة بيانات إنزيم تقييد Bioperl بالكامل، ولكن يمكن إضافة الإنزيمات المرغوبة أيضا (موقع إنزيما أو تقييد ^) لا يتم استخدام isoshizomers لحسابات (ولكن تظهر في الأجزاء الناتجة. يمكن تقسيم التسلسلات إلى نفس الطول أم لا، ولكن بالنسبة إلى gelimage تستخدم التسلسلات الأصلية يمكن استخدام عصابات علامات الوزن الجزيئية المرغوبة خيار تسمية الصور (مع اسم التسلسل) الكثير من تنسيقات مختلفة في الإخراج مدعومة (bioperl) إساءة استخدام البرنامج لخفض تسلسل التمهيدي من مجموعة من التسلسل: 1. في واحد تسلسل خفض التسلسل التمهيدي يدراوي 2. استيراد جميع التسلسلات (FASTA) 3. اختر: TRIMM = 1، aligned_format = 'fasta' التلقائي إزالة تسلسل محاذاة سيئة اختار مجموعة من إنزيمات تقييد عمليات البحث (4، 6، .. القاطع التلقائي التلقائي التلقائي (لا يعمل مقابل كمية كبيرة من SEQ؛ إذا لم تنجح، فحاول مع عدد أقل من التسلسل، ومحاذاة Exopr في FASTA، وانضم إلى جميع التسلسلات مرة أخرى، وحساب المتطلبات بالكامل حيث سيتم تخزين جميع الملفات إذا فشلت كتابة الملفات، فسيتم تخزين الرسائل حيث يتم تخزين TextFile مع شظايا الإنزيم طابع زمني لطيف "إنساني". يتم تنسيق ملف Inzyme Sharges الآن باستخدام مسافات بدلا من علامات التبويب -> هذا يجعل الأمر يسهل على ذلك قراءة في محرر النصوص، ولكن أكثر صعوبة في الحالات إلى الجداول.
مخطط RFLP. برامج ذات صلة
