 | خط أنابيب مرافق البروتينات المركزيةخط أنابيب لتحليل بيانات MS / MS البروتيوم |
| التحميل الان | |
خط أنابيب مرافق البروتينات المركزية الترتيب والملخص
الإعلانات
خط أنابيب مرافق البروتينات المركزية العلامات
خط أنابيب مرافق البروتينات المركزية وصف
خط أنابيب لتحليل بيانات بروتيوم MS / MS خط أنابيب (CPFP) مركزي (CPFP) هو خط أنابيب لتحليل بيانات MS / MS البروتيوتي المستهدفة عند احتياجات المرافق الأساسية للبروتوكولات الأكاديمية. يستخدم خط الأنابيب محركات بحث متعددة وأدوات خطوط أنابيب Proteomic Trans (TPP) عبر البحث عن مجموعات بيانات LC-MS-MS / MS البروتيوتومات الصغيرة. يدعم CPFP حاليا عمليات البحث مع Mascot (Matrix Science)، Tandem (أصلية و K النتيجة)، وأوماتسا. يسمح نموذج واحد بالتقديم إلى جميع البرامج الثلاثة، دون الحاجة إلى إنشاء ملفات المعلمات واختلافات التوفيق في مواصفات التعديل، إلخ. يتم إجراء المعالجة باستخدام وظائف على كتلة Gridengine، مما يتيح أن يتم تخصيص خط الأنابيب بسهولة مثل حجم البيانات يتم تحليل الزيادات. كمية ITRAQ و ISOTOPE المسمى الكمي (SILAC / Dimethyl / Icat) يمكن إجراءها داخل Pipeline.cpfp تمت كتابته في جامعة أكسفورد حيث تم تطويره بنشاط واستخدامه يوميا لدعم احتياجات منشأة أكسفورد الأساسية. يتم إصدارها هنا كبرنامج مفتوح المصدر بموجب ترخيص CDDL.
خط أنابيب مرافق البروتينات المركزية برامج ذات صلة
