الكيمياء :: ملف :: PDB قارئ تنسيق ملف بيانات البروتين / الكاتب
التحميل الان

الكيمياء :: ملف :: PDB الترتيب والملخص

الكيمياء :: ملف :: PDB العلامات

قارئ بيرل PDB قارئ PDB كاتب PDB بنك بيانات البروتين

الكيمياء :: ملف :: PDB وصف

برنامج Protein Data Bank Folution Reader / Writer الكيمياء :: ملف :: PDB هو وحدة بيرل التي يقرأ ويكتب ملفات PDB. يستخدم تنسيق ملف PDB بشكل شائع لوصف البروتينات، خاصة تلك المخزنة في بنك بيانات البروتين (http://www.rcsb.org/pdb/). تقرأ الإصدار الحالي من هذه الوحدة فقط أنواع السجلات فقط، وتجاهل كل شيء آخر: وحدة atom hetatm endmdl endthis تلقائيا تسجل تنسيق "PDB" مع الكيمياء :: MOL، بحيث يمكن تحديد ملفات PDB وقراءتها بواسطة الكيمياء :: MOL > قراءة (). بالنسبة إلى Burpuses Autodetection، يفترض أن الملفات المنتهية في .pdb أو وجود خط مطابق / ^ (Atom | Hetatm) / هي ملفات PDB. تم تصميم قارئ PDB والكاتب للتعامل مع الكيمياء :: كائنات Macromol، ولكن يمكن أيضا إنشاء واستخدام الكيمياء :: كائنات MOL عن طريق إلقاء بعض المعلومات بعيدا .Synopsis استخدم الكيمياء :: ملف :: PDB؛ # قراءة ملف PDB بلدي $ macro_mol = الكيمياء :: macromol-> قراءة ("myfile.pdb")؛ # كتابة ملف PDB $ macro_mol-> الكتابة ("Out.PDB")؛ # قراءة جميع الطرز في ملف متعدد النمذات بلدي mols = الكيمياء :: macromol-> قراءة ("models.pdb")؛ # قراءة نموذج واحد في وقت واحد لي ملف $ = الكيمياء :: Macromol-> ملف ("models.pdb")؛ ملف $-> فتح؛ بينما (بلدي $ مول = $ file-> read_mol (ملف $-> fh)) {# افعل شيئا مع متطلبات $ Mol}: perl.

الكيمياء :: ملف :: PDB برامج ذات صلة