الذهاب :: Apphandle. انتقل :: Apphandle هو معالج API بيانات الجينات الجينات.
التحميل الان

الذهاب :: Apphandle. الترتيب والملخص

الذهاب :: Apphandle. العلامات

الوحدة النمطية بيرل api. علم الوجود جين هذا هو المواد التي سوف تستخدم معالج واجهة برمجة التطبيقات

الذهاب :: Apphandle. وصف

انتقل :: Apphandle هو معالج API بيانات API للجينات الجينات. Go :: Apphandle هو بيانات api Handler api handler.synopsis العودة :: Apphandle؛ بلدي $ dbname = "اذهب"؛ # الاتصال بقاعدة بيانات على مضيف معين $ Apph = انتقل :: Apphandle-> Connect (-dbname => $ dbname، -dbhost => $ mysqlhost)؛ # مثال 1 # جلب مصطلح من DataSource $ Term = $ apph-> get_term ({acc => "go: 0003677"})؛ Printf "مدة مدة؛ اسم = S Go ID = SN"، $ المدى-> الاسم ()، $ المدى-> public_Acc ()؛ # مثال 2 # جلب قائمة الجمعيات إلى ER # (وكل شروط التنقل الفرعية من ER، أو # الموجودة داخل ER) والتي يوجد بها أدلة جيدة بشكل معقول # (المؤلف المرجع أو الفحص المباشر) $ Assoccs = $ apph-> get_associations ({name => "endoplasmic reticulum"}، {evcodes => })؛ foreach بلدي Assoc compan (@ Assoccs) {printf "الجينات: S دليل الجمعية: S S"، $ option-> gene_product-> الرمز، $ option-> الأدلة-> رمز ()، Assoc-> دليل-> Xref-> xref_key ()؛ } # مثال 3 # جلب رسوخا من GO $ Graph = $ apph-> get_graph (-ACC => 3677، -depth => 3)؛ foreach بلدي مصطلح بلدي (@ $ graph-> get_all_nodes}) {printf "مدة التنقل؛ الاسم = S GO ID = SN"، $ المدى-> الاسم ()، $ المدى-> public_Acc ()؛ } # # مثال 4 # جلب مجموعة فرعية من الذهاب، و # واستخدام الرسم البياني للمكفوفين إلى # عرض الرسم البياني $ الرسم البياني = $ apph-> get_graph_by_search ("dna helicase *")؛ $ it = $ graph-> create_iterator؛ بينما (بلدي $ ni = $ it-> next_node_instance) {$ عمق = $ ni-> عمق؛ $ المدى = $ ni-> مصطلح؛ PrintF " S LEAM = s ( s) // n_assocs = s // العمق = DN"، -> n_associations || 0، عمق $؛ } # # مثال 5 # جلب مجموعة فرعية من الذهاب، # تقييد المنتجات الجينية # احصل على جميع المصطلحات التي تم استخدامها للتعليق على هذين جينات SGD اثنين $ شروط = $ apph-> get_terms ({products => })؛ # بناء الرسم البياني على طول الطريق إلى العقد ورقة # من الشروط أعلاه $ الرسم البياني = $ apph-> get_graph_by_terms (شروط $، -1)؛ # إنشاء جهاز كمتقل على الرسم البياني $ IT = $ graph-> create_iterator؛ # تكرر من خلال كل عقدة في الرسم البياني أثناء (بلدي $ NI = $ IT-> next_node_instance) {$ عمق = $ ni-> عمق؛ $ المدى = $ ni-> مصطلح؛ PrintF " S LEAL = s ( s) // ospeSs = SN"، $ _-> gene_product-> ACC} @ {$ المدى-> Association_List})؛ } متطلبات: perl.

الذهاب :: Apphandle. برامج ذات صلة