الذهاب :: AnnotationProvider :: AnnotationParser انتقل :: AnnotationProvider :: AnnotationParser هو وحدة بيرل التي يمكن أن تحليل ملف توضيحي جين.
التحميل الان

الذهاب :: AnnotationProvider :: AnnotationParser الترتيب والملخص

الذهاب :: AnnotationProvider :: AnnotationParser العلامات

الوحدة النمطية بيرل محلل حاشية. ملاحظة جين التوضيحي الجينات محلل التوضيحية

الذهاب :: AnnotationProvider :: AnnotationParser وصف

انتقل :: AnnotationProvider :: AnnotationParser هو وحدة بيرل التي يمكن أن تحليل ملف توضيحي الجينات. انتقل :: AnnotationProvider :: AnnotationParser هو وحدة بيرل التي يمكن أن تحليل ملف تعريف التوضيح الجيني .synopsisgo :: AnnotationProvider :: AnnotationParser - يقرأ ملف جمعيات جينات الجينات الجينية، ويوفر طرقا لاسترداد التوضيحات النهائية للكيان المشروح وبعد ملاحظة، إنها غير حساسة للحالة، مع بعض التحذير - انظر الوثائق أدناه. My $ AnnotationParser = GO :: AnnotationProvider :: AnnotationParser-> جديد (AnnotationFile => "البيانات / gene_association.sgd")؛ بلدي $ geneName = "AAT2"؛ طباعة "Go Lesquess for Gene:"، انضم (""، AnnotationParser-> goidsbyname (الاسم => $ cenname، الجانب => 'p'))، "n"؛ طباعة "معرف قاعدة البيانات للجين:"، $ AnnotationParser-> DatabaseDByName ($ الاسم)، "N"؛ طباعة "اسم قاعدة البيانات:"، $ AnnotationParser-> DatabasEname ()، "N"؛ طباعة "الاسم القياسي للجين:"، $ AnnotationParser-> DirectoryNameByName ($ اسم GeneName)، "N"؛ بلدي $ الأول MyGenEnsames = AnnotationParser-> Allstardnames ()؛ Foreach $ i (0..10) {print "أسماء جينات دولية n"؛ } انتقل :: AnnotationProvider :: AnnotationParser هي فئة فرعية ملموسة من GO :: AnnotationProvider، وإنشاء تعيين هيكل البيانات أسماء جينات للذهاب عبر التعليقات التوضيحية عن طريق تحليل ملف التعليقات التوضيحية المقدمة من Consortium Gene Ontology.This توفر طرق كائنات لاسترداد الذهاب التعليقات التوضيحية التي تم تحليلها من ملف "الجينات الجينات"، والتي توفرها كونسورتيوم الجينات الجينية. تنسيق الملف هو: خطوط تبدأ ب "!" الشخصية هي خطوط التعليق. محتويات العمود Cardinality --------------- ------------------------------ ------------------------------- 01 اختصار قاعدة البيانات لمصدر التوضيحية (مثل SGD) 11 معرف قاعدة البيانات لل الكيان المشروح 21 الاسم القياسي للكيان المشروح 30،1 غير مشروح على وجه التحديد عدم وجود تحديد على وجه التحديد إلى الفصل) 41 Goid من التوضيحية 51، N المرجع (المراجع) لإدخال الشرح 61 رمز دليل الشرح 70، ن مع أو من (غامض بعض الشيء) 81 جانب من جوانب التوضيحية (C، F، P) 90،1 اسم المنتج الذي يتم تسجيله 100، n الاسم المستعار (ES) من المنتج المشروح 111 نوع الكيان المشروح (أحد الجينات، نسخة من النصوص، البروتين) 121،2 معرف تصنيفي للترميز و / أو استخدام المنتج 131 تاريخ التعليق YYYYMMDD 141 تعيينه: قاعدة البيانات التي جعلت المعطيات التي جعلت من البلوزات البرجانية مفصولة بعلامات تبويب. بالنسبة لأولئك الإدخالات ذات تصرفات أكبر من 1، توجد إدخالات متعددة أنابيب، |، يمكن العثور على تفاصيل محددة. تفاصيل في: http: //www.geneontology.org/doc/go.annotation.html#Filethe بعد الافتراضات حول الملف يتم (ويجب أن تكون صحيحة): 1. تظهر جميع الأسماء المستعارة لجميع مداخل المنتج المشروح معين 2. معرفات قاعدة البيانات فريدة من نوعها، في أن اثنين من الكيانات المختلفة لا يمكن أن يكون لها نفس معرف قاعدة البيانات نفسها. متطلبات: perl.

الذهاب :: AnnotationProvider :: AnnotationParser برامج ذات صلة