الذهاب :: عرض
التحميل الان

الذهاب :: عرض الترتيب والملخص

الذهاب :: عرض العلامات

JPG gif. يخلق gif. يخلق JPG. تذهب

الذهاب :: عرض وصف

GO :: اطلع هو وحدة بيرل الذي يخلق GIF أو PNG صورة لتصور GO DAG. GO :: اطلع هو وحدة بيرل الذي يخلق GIF أو PNG صورة لتصور GO DAG.This بيرل وحدة يولد الرسم الذي يعرض الأم والطفل العلاقات ذات المدى GO المحدد. كما يوفر التصور لGO :: TermFinder بيرل وحدة أنشأتها قاعدة بيانات ستانفورد ميكروأري (القطارات). هذه الوحدة هي مفيدة عند تحليل التجريبية أو النتائج الحسابية التي تنتج مجموعة من المنتجات الجينات التي قد يكون لها وظيفة مشتركة أو استخدام process.SYNOPSIS GO :: مشاهدة. بلدي $ goView = GO :: عرض-> الجديدة (-goid => $ goid، -ontologyProvider => $ الأنطولوجيا، -annotationProvider => $ الشرح، -termFinder =>pvalues، -aspect => 'P'، -configFile => $ confFile، -imageDir => "/ تمة"، -imageUrlRoot => "http://www.ABC.com/tmp"، -imageName => "GOview.88.png"، -tree => 'حتى .، -imageLabel => "SGD") '، -nodeUrl => $ goUrl، -geneUrl => $ geneUrl، -pvalueCutOff =>' 0.01 ' حجة المطلوبة تتوقعه البيانات ونوع -------------------------------------------- ----------------------------- -goid لا الجين الأنطولوجيا ID (GOID). إذا كان يتم تمرير أي شيء في، وحدة سيتم استخدام الجزء العلوي goid كل فرع الأنطولوجيا (أي، goid لmolecular_function، biological_process، أو cellular_component) -ontologyProvider نعم إن الأنطولوجيا المثال الموفر. -annotationProvider لا مثيل مزود الشرح. هو مطلوب منها لخلق شجرة نتيجة GO الأجل الباحث. -termFinder لا هناك مجموعة من المراجع التجزئة عاد من طريقة "findTerms" وحدة GO :: TermFinder. هو مطلوب منها لخلق شجرة نتيجة GO الأجل الباحث. -aspect لا. جانب من جوانب مزود الأنطولوجيا. هو مطلوب منها لخلق شجرة نتيجة GO الأجل الباحث. -configFile نعم ملف التكوين لتحديد المتغيرات العامة لعرض الرسوم البيانية. -imageDir نعم الدليل لتخزين ملف الصورة التي تم إنشاؤها حديثا. يجب أن يكون العالم (لا أحد) مقروء وقابل للكتابة إذا كنت ترغب في عرض الصورة على شبكة الإنترنت. -imageUrlRoot لا جذر رابط ل-imageDir. هو مطلوب منها إذا كنت ترغب في عرض الصورة على شبكة الإنترنت. -imageName لا اسم ملف الصورة. افتراضيا، سيكون اسم شيء من هذا القبيل "GOview.xxxx.png. أن 'XXXX' أن يكون معرف العملية. A احقة للصورة (بابوا نيو غينيا. أو gif.) لا ينبغي المقدمة، والتي من شأنها أن تحدد في وقت التشغيل، اعتمادا على قدرات مكتبة GD. -treeType لا. نوع الشجرة. 1. حتى => عرض شجرة سلف لgoid معين. 2. أسفل => عرض الشجرة أصل أفريقي لgoid معين. افتراضيا، فإنه سيتم عرض الشجرة أصل أفريقي. -geneUrl لا وURL لكل جين لتصل إلى. فإنه يحتاج إلى أن يكون النص في عنوان الموقع الذي سيتم استبداله من قبل goid الحقيقي للعقدة. -nodeUrl لا رابط لكل عقدة GO لتصل إلى. فإنه يحتاج إلى أن يكون النص في عنوان الموقع الذي سيتم استبداله من قبل goid الحقيقي للعقدة. -pvalueCutOff لا وقطع القيمة الاحتمالية لعرض الرسم لGO الأجل الباحث. الافتراضي هو 0.01 -imageLabel لا تسمية الصورة التي سوف تظهر في أسفل الزاوية اليسرى من الخريطة. -------------------------------------------------- ---------------------- لعرض الصورة على شبكة الإنترنت: $ goView-> showGraph. لخلق وصورة عودة اسم الملف مع المسار الكامل: بلدي $ imageFile = $ goView-> createImage. متطلبات: perl.

الذهاب :: عرض برامج ذات صلة