البروتينالشوب البروتينالوب هو أداة تفاعلية لمعالجة هياكل البروتين.
التحميل الان

البروتينالشوب الترتيب والملخص

البروتينالشوب العلامات

تلاعب بروتين أداة تفاعلية المعلوماتية الحيوية تطبيق المعلومات الحيوية مناور البروتين

البروتينالشوب وصف

البروتين شوب هو أداة تفاعلية لمعالجة هياكل البروتين. البروتين شوب هو أداة تفاعلية لمعالجة هياكل البروتين. تم تصميمه لإنشاء مجموعة من تكوينات البروتين بسرعة باستخدام المعرفة الإنسانية والحدس. يمكن التعرض لهذه التكوينات للتحسين المحلي أو العالمي. على الرغم من أن البروتين شوب لا يؤدي عملية التحسين العالمية نفسها، إلا أنها توفر إطارا يمكن استخدامه للتفاعل مع عملية تحسين عالمية قد تكون قيد التشغيل على جهاز بعيد. يعرض ProteinShop ثلاثة مستويات من الوظائفألفلفل الأول: عرض هيكل بروتين ثلاثي الأبعاد إنشاء البروتين ثلاثي الأبعاد "من الصفر"، أي حمض أميني واحد في كل مرة، من تسلسل الأحماض الأمينية وتوقعات هيكل ثانوي. تحميل هيكل البروتين ثلاثي الأبعاد من ملف PDB. تقديم تقنيات التصور القياسية مثل Sphere Atom، Bond Stick ورؤوس الرسوم المتحركة. من خلال السماح بالتوافق والشعير والطقس. تشكل ورقة بيئة بيتا متوازية / مضاد للحفظ. حفظ / تحميل شظايا البروتين لإعادة استخدامه في التكوين الآخر S. مساعدة محاذاة الهياكل الثانوية لتشكيل هياكل التعليم العالي من خلال توفير أدلة التصور والعلامات مثل تقديم رابطة الهيدروجين وتصور الاصطدام الذرة. تغيير أنواع الهيكل الثانوي للأحماض الأمينية المختارة "على ذبابة" لتجربة الثانوية الضعيفة أو المتضاربة تنبؤات الهيكل. تقييم طاقة بنية البروتين ثلاثية الأبعاد باستخدام رمز حساب الطاقة من الخارج. تصور Energy Energy.Level III: مراقبة / توجيه عملية تحسين عالمية (عن بعد) الاتصال ب / غير منفصل من عملية تحسين عالمية. تنزيل تكوينات المرشحين من عملية التحسين. تحميل التكوينات المعالجة لعملية التحسين. رصد عملية التحسين عن طريق تنزيل شجرة التكوين بأكملها. توجد بعض الميزات الرئيسية ل "البروتينشوب": يساعد الباحثين تلقائيا على إنشاء هياكل التعليم العالي تلقائيا من التوقعات والهيكل الثانوي متاح من خوادم التنبؤ في الوصول إلى الإنترنت. ذلك ه أذنين العلماء لتطبيق المعرفة والحليفة الكيميائية الحيوية خلال التلاعب التفاعلي في هياكل البروتين. توفر تصور الطاقة المجانية المحسوبة أثناء النمذجة لتسهيل المقارنة وتحليل الهياكل البديلة. تسرع اكتشاف تكوينات منخفضة للطاقة من خلال تطبيق التحسينات المحلية هياكل البروتين المحددة من قبل المستخدم. يقوم تلقائيا بإنشاء مجموعة متنوعة من تكوينات التنسيق الإصدار التجريبي استنادا إلى احتمالات طبولوجيا الأوراق المسرحية التجريبية ومحاذاة مطابقة. الإبلاغ: OpenGL أو GL لتقديم ثلاثي الأبعاد Fltk For Gui العنبر لحساب الطاقة: استخدم MakeFiles القياسية المدرجة في دليل SRC.go إلى دليل "SRC" ثم اكتب "جعل" لبناء البروتين. *** يتوقع إعداد FLTK في مترجم Makefilethe تتضمن الملفات ضمن $ (FLTK_BASE) / $ (IncDir)، المكتبات ضمن $ (FLTK_BASE) / $ (Libdir)، وأي أدوات بناء مطلوبة ضمن (FLTK_BASE) / $ (Bindir). إذا كان لديك إعداد مختلف، فأنت بحاجة إلى تحرير إشارات المحول البرمجي أدناه .FLTK_BASE = / USR / Localon بعض المنشآت، ووظائف OpenGL FLTK في الانفصال، libfltk_gl. إذا اشتكي الرابط من undefinedsymbols، فحاول إضافة -LFTK_GL إلى الخط أدناه قبل -lfltk.fltk_libs = -l $ (fltk_base) / $ (libdir) -ltk_gl -ltk

البروتينالشوب برامج ذات صلة